最高のGitクライアントはPhpStormだ。
リモートブランチからチェックアウトすると、元のリモートブランチが追跡先になります。リモートブランチから新しくブランチを切りたい場合、これではマズいので、チェックアウトしたブランチはそのまま追跡先のリモートブランチを切り替えます。
$ git branch -u origin/[[ブランチ名]]-u は別名なので、以下のように指定するのが本物っぽいです。
$ git branch --set-upstream-to=origin/[[ブランチ名]]